Гамсахурдия и его соседа Давида Баджелидзе доставили в больницу в конце октября 2009 года. Первому была сделана срочная операция, а Гамсахурдия, у которого были повреждения головы, оказали первую помощь. Затем Гамсахурдия арестовали по подозрению в том, что он стрелял в Баджелидзе.

Цотнэ Гамсахурдия, в свою очередь, заявил, что в людей не стрелял, а, наоборот, сам стал жертвой нападения. По словам Цотнэ Гамсахурдия, его ударили по голове, он потерял сознание, а затем, когда пришел в себя, был задержан полицией.

Любопытно, что в ноябре 2007 года против Цотнэ Гамсахурдия было возбуждено дело о шпионаже в пользу России и антиправительственном заговоре. А спустя год Гамсахурдия задержали в Тбилисском аэропорту по возвращении из Москвы, где он жил в последние годы. Тогда Тбилисский городской суд избрал для него двухмесячное предварительное заключение, хотя вскоре Гамсахурдия освободили под залог. В конце января 2010 года стало известно, что к числу обвинений Гамсахурдия было добавлено обвинение в нанесении телесного повреждения полицейскому Левану Саникидзе. В частности, в 1998 году между Гамсахурдия и Саникидзе произошел инцидент, в результате которого оба получили телесные повреждения. К рассмотрению этих дел суд пока не приступал.