Некоторые эксперты заявили, что сервис «Яндекс.Пробки» искажает информацию о заторах в Москве из-за ангажированности московскими властями. Также некоторые водители сообщили, что сервис нередко ошибается.

Однако аналитик «Яндекс.Пробки» Леонид Медников заявил РСН, что сервис работает честно и не зависит от московских властей. При этом Л.Медников признал, что сервис допускает ошибки, которые организация старается оперативно устранять. Аналитик сервиса пояснил, что сбои в работе случаются из-за того, что система построена на водителях, от которых иногда могут поступать не совсем верные данные.