Декана подозревают в растрате полумиллиона рублей при ремонте здания факультета. В то же время есть сведения о том, что уголовное дело в отношении Шишкиной возбуждено за два договора возмездного оказания услуг деканом журфака. На основании этих договоров из внебюджетных средств шла доплата к основной зарплате сотрудников.
Интересно, что ранее СПбГУ подавал в суд на Марину Шишкину, которая подвергла резкой критике деятельность ректора вуза Николая Кропачева, «учителя и наставника президента Медведева». В иске требовалось признать распространенные Шишкиной сведения о СПбГУ «несоответствующими действительности и порочащими деловую репутацию вуза».