За четыре дня до гибели Магнитского Тверской суд продлил срок его ареста до 26 ноября. Это решение было обжаловано, жалобу и рассмотрит Мосгорсуд. В своем последнем выступлении перед судом Магнитский заявлял о бесчеловечных условиях содержания.
Глава Hermitage Capital Уильям Браудер утверждает, что Магнитского шантажировали и он умер в тюрьме из-за того, что ему было отказано в медицинской помощи.
Правоохранительные органы утверждают, что Магнитский не жаловался на здоровье.