Перед первым заседанием по этому делу Россия представила нового судью, которому понадобилось время на изучение материалов. А во второй раз процесс был отложен «в связи с невозможностью присутствия судьи Андрея Бушева, а также представителя правительства РФ Георгия Матюшкина». 

ЮКОС обвиняет российские власти в нарушении статьи 6 Европейской конвенции по правам человека (право на справедливое судебное разбирательство), допущенном в ходе расследования дела о неуплате компанией налогов за 2000 год. Кроме того, в жалобе говорится, что в ходе судебного преследования ЮКОСа российские официальные лица нарушили статью 1 конвенции (обязанность уважать права человека), ст. 13 (право на эффективное средство правовой защиты), ст. 14 (запрет дискриминации), ст. 18 (пределы использования ограничений в отношении прав).