На заседании накануне адвокаты подсудимых заявили ряд ходатайств. В частности, они просили отвести группу прокуроров, с участием которых рассматривается дело. Защита считает, что у гособвинителей есть личная заинтересованность в исходе процесса. Суд с таким мнением не согласился и требования об отводе не удовлетворил.

Защита Ходорковского и Лебедева считает, что уголовное дело против них должно быть прекращено в связи с правовой позицией России, озвученной в Европейском суде по правам человека. «Уголовное преследование должно быть прекращено, а процесс — немедленно остановлен», — заявила адвокат Ходорковского Карина Москаленко. Она пояснила, что Ходорковского и Лебедева обвиняют в хищении чужого имущества, доходы от которого они легализовали. При этом в разъяснениях, которые РФ предоставила в Страсбург иску иностранных акционеров ЮКОСа, говорится, что ЮКОС был собственником всей добытой нефти.

Ходорковский был арестован в конце 2003 года, Лебедев - в июле 2003 года. Оба приговорены к девяти годам по обвинению в мошенничестве и неуплате налогов. Позже Мосгорсуд снизил наказание до восьми лет каждому. В 2009 году Ходорковский и Лебедев были возвращены в Москву в связи с судом по второму делу. По новым обвинениям Генпрокуратура  инкриминирует бывшим руководителям ЮКОСа «хищение чужого имущества организованной группой в крупном и особо крупном размерах и его легализацию».