До этого он возглавлял УФСБ Башкирии и руководил операциями по зачистке этой республики от диверсионных групп исламских террористов.

Как пишет Росбалт, Виктор Палагин — кадровый сотрудник КГБ — ФСБ. В середине 2000-х занимал должность заместителя начальника Управления ФСБ России по Курской области, в 2005 году возглавил УФСБ по Республике Марий Эл, а в декабре 2008 года получил новое назначение — стал главным чекистом Башкирии. В 2013 году был назначен вице-президентом ОСК по безопасности.

Источник «Росбалта» рассказал, что Палагин считается в системе контрразведки одним из лучших специалистов по борьбе с запрещенной в России экстремистской организацией  «Хизб ут-Тахрир».

Под его руководством в Башкирии был проведен ряд успешных операций в отношении участников диверсионных групп, готовивших теракты на территории республики.